Katedra za biofiziku i radiologiju

Popis studenata

SEMINARI:

 

S1  Seminar   S2
1 NINA ALEBIĆ  1   1 NIKOLA KRTALIĆ 1
2 LEONARDA ANĐELIĆ  2   2 ASJA KUKO 2
3 MELISA AVDIĆ  3   3 BRUNO KUZMAN 3
4 SENAD BAJAT  4   4 NIKOLINA LJUBIĆ 4
5 ZVONIMIR BARIŠIĆ  6   5 MARINA LUČIĆ 6
6 ANTONIO BARNJAK  7   6 MIRZA MEĐEDOVIĆ 7
7 VALENTINA BEGIĆ  8   7 MARTINA MIJATOVIĆ 8
8 KATARINA BLAŽANOVIĆ  9   8 MISLAV MILAS 9
9 MARCELA BOJČETIĆ  10   9 ELIZABETA DOLORES MILIĆEVIĆ 10
10 PETRA BOŠKOVIĆ  11   10 IVA MUSA 11
11 KATARINA BOŠNJAK  16   11 ALMEDINA OMANOVIĆ 16
12 MISLAV BOŽIĆ  17   12 DORA OSTOJIĆ 17
13 FILIP BRAOVAC  18   13 KATICA PAŽIN 18
14 KARLA BUHOVAC  19   14 KATARINA PETROVIĆ 19
15 IVONA BULIĆ  20   15 HELENA PRGOMET 20
16 ŠEJLA ČAMPARA  21   16 MARIJA PRIMORAC 21
17 RIAD ČILIĆ  23   17 LUCIA PRSKALO 23
18 ANA-MARIJA ČOLAK  24   18 MARIJA PRSKALO 24
19 MATEA ĆORIĆ  40   19 MARKO RASPUDIĆ 40
20 SERGIO DŽIDIĆ  26   20 GABRIELA ROZIĆ 26
21 ADNAN FAZLAGIĆ  27   21 SLAVEN SABLJO 27
22 PETRA GOLEMAC  28   22 NIKA SAMARDŽIĆ 28
23 HARIS HADŽIĆ  29   23 LEONARDA SESAR 29
24 JELENA HAUSER  30   24 JUSUF STRANJAK 30
25 SUNČICA HUMAČKIĆ  31   25 IVANA SUŠAC 31
26 FILIP JADRIJEVIĆ  32   26 PAULA ŠIMAŠEK 32
27 DANE JELAVIĆ  33   27 ANITA ŠUŠNJA 33
28 LOVRE JUKIĆ  34   28 VERONIKA ŠUTALO 34
29 MIA JURIŠIĆ  35   29 KRISTINA TIKVIĆ 35
30 IVANA KOSORČIĆ  36   30 GABRIELA TOPIĆ 36
31 Ana Marija Laco  37   31 KATARINA TOPIĆ 37
32 Vidan Janjić  38   32 LANA VIDIĆ 38
33         33 IVAN VRDOLJAK 39

 

  SD
1 Anić (SD) Antonia 43    
2 Biško Katarina 42
3 Bubalo Andrea 41
4 Bučić (SD) Karla 1
5 Bulić (SD) Ružica 2
6 Čizmek (SD) Robert 3
7 Čolak Mislav 4
8 Demo (SD) Josipa 6
9 Dugandžić Mirna 7
10 Ferenčak (SD) Klara 8
11 Franjić Dario 9
12 Jurišić Filip 10
13 Karačić Matea 11
14 Karlo (SD) Antonela 16
15 Kežić (SD) Marijeta 17
16 Ljeljak Selma 18
17 Matić Laura 19
18 Nikolić (SD) Marijan 20
19 Pandža Marija 21
20 Prlić Ivan 23
21 Puntijar (SD) Petra 24
22 Sesar (SD) Vinko 26
23 Stojčić Iva 27
24 Šego Fabijan 28
25 Tolić Grgo 29
26 Veledar Adnan 30
27 Vlaho Ela 31
28 Vukoja Marko 32
29 Vukonić (SD) Petra 33
30 Vukovarac (SD) Tena 34

 

VJEŽBE:

V1   V4
1 NINA ALEBIĆ   1 NIKOLA KRTALIĆ
2 LEONARDA ANĐELIĆ   2 ASJA KUKO
3 MELISA AVDIĆ   3 BRUNO KUZMAN
4 SENAD BAJAT   4 NIKOLINA LJUBIĆ
5 ZVONIMIR BARIŠIĆ   5 MARINA LUČIĆ
6 ANTONIO BARNJAK   6 MIRZA MEĐEDOVIĆ
7 VALENTINA BEGIĆ   7 MARTINA MIJATOVIĆ
8 KATARINA BLAŽANOVIĆ   8 MISLAV MILAS
9 MARCELA BOJČETIĆ   9 ELIZABETA DOLORES MILIĆEVIĆ
10 PETRA BOŠKOVIĆ   10 IVA MUSA
11 Ana Marija Laco   11 ALMEDINA OMANOVIĆ
             
             
             
             
V2   V5
1 KATARINA BOŠNJAK   1 DORA OSTOJIĆ
2 MISLAV BOŽIĆ   2 KATICA PAŽIN
3 FILIP BRAOVAC   3 KATARINA PETROVIĆ
4 KARLA BUHOVAC   4 HELENA PRGOMET
5 IVONA BULIĆ   5 MARIJA PRIMORAC
6 ŠEJLA ČAMPARA   6 LUCIA PRSKALO
7 RIAD ČILIĆ   7 MARIJA PRSKALO
8 ANA-MARIJA ČOLAK   8 MARKO RASPUDIĆ
9 MATEA ĆORIĆ   9 GABRIELA ROZIĆ
10 SERGIO DŽIDIĆ   10 SLAVEN SABLJO
11 Janjić Vidan   11 NIKA SAMARDŽIĆ
             
             
             
V3   V6
1 ADNAN FAZLAGIĆ   1 LEONARDA SESAR
2 PETRA GOLEMAC   2 JUSUF STRANJAK
3 HARIS HADŽIĆ   3 IVANA SUŠAC
4 JELENA HAUSER   4 PAULA ŠIMAŠEK
5 SUNČICA HUMAČKIĆ   5 ANITA ŠUŠNJA
6 FILIP JADRIJEVIĆ   6 VERONIKA ŠUTALO
7 DANE JELAVIĆ   7 KRISTINA TIKVIĆ
8 LOVRE JUKIĆ   8 GABRIELA TOPIĆ
9 MIA JURIŠIĆ   9 KATARINA TOPIĆ
10 IVANA KOSORČIĆ   10 LANA VIDIĆ
11       11 IVAN VRDOLJAK
V7
1 Anić (SD) Antonia
2 Biško Katarina
3 Bubalo Andrea
4 Bučić (SD) Karla
5 Bulić (SD) Ružica
6 Čizmek (SD) Robert
7 Čolak Mislav
8 Demo (SD) Josipa
9 Dugandžić Mirna
10 Ferenčak (SD) Klara
     
     
V8
1 Franjić Dario
2 Jurišić Filip
3 Karačić Matea
4 Karlo (SD) Antonela
5 Kežić (SD) Marijeta
6 Ljeljak Selma
7 Matić Laura
8 Nikolić (SD) Marijan
9 Pandža Marija
10 Prlić Ivan
     
     
V9
1 Puntijar (SD) Petra
2 Sesar (SD) Vinko
3 Stojčić Iva
4 Šego Fabijan
5 Tolić Grgo
6 Veledar Adnan
7 Vlaho Ela
8 Vukoja Marko
9 Vukonić (SD) Petra
10 Vukovarac (SD) Tena

Fizika s osnovama radiologije

  1. Katedra za Biofiziku, biologiju i kemiju

  2. Studij: Sveučilišni preddiplomski studij Fizioterapija

  3. Predmet: Fizika s osnovama radiologije

  4. Nositelj predmeta: prof.dr.sc. Dario Faj

  5. Suradnici na predmetu zaposleni na MF Osijek: doc. dr.sc. Hrvoje Brkić, doc. dr.sc. Mladen Kasabašić, Nevija Brstilo

  6. ECTS bodovi: 3
  7. Akademska godina: 2020./2021.
  8. Godina studija: 1
  9. Termin izvođenja nastave: 30.11.2020. - 11.12.2018.

  1. Organizacija nastave: Turnusna

  2. Broj sati nastave prema vrsti nastave:   Predavanja: 30 sati;  vježbe 15 sati

Broj studenata: 30

OPIS PREDMETA

Ciljevi predmeta: Upoznavanje s osnovnim konceptima izabranih područja biofizike i njihova primjene u fizioterapiji. Usvajanje znanja potrebnih za praćenje i usvajanje sadržaja predmeta uže stručne discipline i kliničkih znanosti. Upoznati studenta s osnovama radioloških metoda primjenjivim u fizioterapiji i osnova zaštite od zračenja u medicini. Cilj je poticati na analitički, kvantitativni pristup u proučavanju funkcija ljudskog tijela

Razvijanje općih i specifičnih kompetencija (znanja i vještina)

Sadržaj predmeta:

Fizikalne veličine i jedinice; mehanika krutog tijela; sile, moment sile, poluge u terapiji, elastične deformacije, elastična svojstva kosti, krvnih žila i mišića; mehanika tekućina i plinova; hidrostatika, zakoni idealnog plina, pojave u vezi s napetošću, viskozna svojstva, difuzija; akustika i ultrazvuk; termodinamika biološkog sustava; elektromagnetsko zračenje i primjena u medicini; osnove elektriciteta i magnetizma, elektricitet u mirovanju; elektricitet u gibanju; elektromagnetizam; izmjenične struje; elektrokemijske pojave; fiziološko djelovanje električne struje; osnovni elektronički elementi i sklopovi; generatori različitih impulsa; osnovni uređaji u elektroterapiji; metode elektroterapije; učinci električne struje i zaštita.

OBLICI I TERMINI PROVJERE ZNANJA

Način polaganja ispita:
Ispit je podijeljen na četiri dijela:
(1) praktični ispit – donosi do 10 bodova za prolaz je potrebno 6 bodova. Jednom položen, završni praktični ispit priznaje se do kraja akademske godine. Nakon svakog poslanog izvještaja student dobiva povratnu informaciju o broju ostvarneih bodova iz pojedine vježbe
(2) pismeni ispit – 40 pitanja sa višestrukim odgovorima  
(3) seminari
a)    Problemski – izrada seminara na zadani zadatak – najviše 3 boda. Seminar se ne prezentira, nego ga je potrebno poslati do 10. 12. u 20:00 na Ova e-mail adresa je zaštićena od spambota. Potrebno je omogućiti JavaScript da je vidite. . Potrebno je napisati 3-5 A4 stranice, veličina fonta 12, prored 1,5. Seminare poslati u PDF formatu. SVI seminari će biti uspoređeni te će slaganje s već postojećim tekstom vuše od 50 % biti ocijenjeno s -3 (tri negativna) boda
b)    Sudjelovanje u rješavanju numeričkih zadataka – najviše 1 bod
c)    Pismene i usmene provjere znanja tijekom nastave – najviše 6 bodova
Kriterij:
33-35 dovoljan (2)
36-41 dobar (3)
42-50 vrlo dobar (4)
51-60 izvrstan (5)

 (4) usmeni ispit (ukoliko student želi može umjesto pismenog ispita prijaviti usmeni ispit).

 

Gornji način polaganja može se zamijeniti usmenim ispitom. student je dužan najaviti usmeni ispit 7 dana prije održavanja ispitnog roka. Način ocjenjivanja

 

Literatura:

Obavezna literatura:

  1. Zvonimir Jakobović: Fizika i elektrotehnika, Zagreb, 1998.(dostupno u knjižnici Veleučilišta u Vukovaru, u postupku nabave u knjižnici Mefosa)

  2. Jasminka Brnjas-Kraljević: Fizika za studente medicine, Medicinska naklada, Zagreb, 2011 (dostupna u knjižnici mefosa)

  3. Nastavni materijali dani na stranicama Katedre: www.physics.mefos.hr

Dopunska literatura:

  1. Srednjoškolski udžbenici iz fizike

  2. D. C. Giancoli: Physics: Principles with Applications, Sixth Edition, Prentice Hall, Inc., 2004.

  3. Haliday, D.; Resnick, R.; Walker, J.: Fundamentals of Physics, J. Wiley & Sons, New York, 2001.

  4. Hademenos, G. J. : Physics for Pre-med, Biology and Allied Health Students, McGraw Hill, New York, 1997.

 

Način informiranja o predmetu i terminima održavanja konzultacija s nastavnicima i asistentima

Konzultacije traju prije i poslije nastave za vrijeme trajanja turnusa, te svaki ponedjeljak od 08:00 do 10:00 sati. Također dostupan je mail: Ova e-mail adresa je zaštićena od spambota. Potrebno je omogućiti JavaScript da je vidite. za sve upite nastavnicima.

 

nastava se odrzava online preko sustava MS Teams


Vrijeme

Tema

Nastavnik

1. Dan – ponedjeljak

P1

08:30-11:00

Pregled kolegija. Uvod. Podjela seminara i način izvođenja. snovne matematičke funkcije, vektori, Fourierova analiza, integral, diferencijal. Osnovne fizikalne veličine i jedinice. Gibanje tijela (kinematika).

[DF]

2. Dan

P2

08:30-11:00

Termodinamika. Zakoni termodinamike. Kalorimetar. Termodinamika bioloških sustava. Prijenos energije. Difuzija. Prijenos mase.

[DF]

3. Dan

P3

08:30-11:0

Pojam sile i energije. Gibanje čvrstih tijela. Energija tijela. Newtonovi zakoni. Primjeri (gibanja, centrifugalna sila,…). Gibanje i deformacije čvrstih tijela pod djelovanjem sile. Poluga; translacijska i rotacijska ravnoteža. Vrste poluga u ljudskom tijelu. Deformacije čvrstih tijela. Modeliranje bioloških materijala.

[DF]

4. Dan

P4

08:30-11:00

Hidrostatika I hidrodinamika. Tlak. Fizika plinova i primjer primjene u medicini. Pascalov zakon, hidrostatski tlak, uzgon. Bernoullijev zakon. Svojstva realnih tekućina. Poisselov zakon. Napetost površine tekućine. Reološka svojstva krvi. Jednostavniji primjeri primjene osnovnih zakona hidrostatike i hidrodinamike na ljudsko tijelo. Pojave na granici tekućine: adhezijska svojstva stomatoloških materijala.

5. Dan

P5

08:30-11:00

Struktura atoma i molekula. Građa i stabilnost atomske jezgre. Radioaktivnost. Struktura molekule. Kovalentna, ionska i polarna vezanja. Energijska stanja u molekuli. Elektromagnetsko zračenje. Vrste elektromagnetskog zračenja. Dualna svojstva EM svjetlosti (pokus CD kao optička rešetka). Međudjelovanje elektromagnetskog zračenja i materije. Fizikalne osnove rendgenske dijagnostike.

[DF]

6. dan - Ponedjeljak

P6

08:30-11:00

Uvod u elektricitet i magnetizam. Električno i magnetsko polje. Polarizacija. Indukcija. Akcijski potencijal. Fizikalne osnove EKG, EEG I EEG.

[MK]

7. dan - Utorak

P7

8:30-11:00

Djelovanje električne struje na tkivo. Modeli tkiva.

[MK]

8. dan - Srijeda

P8

08:30-11:00

Osnove elektronike

[MK],

9. dan –četvrtak

P9

08:30-11:00

Titranje kao izvor vala. Zvučni val. Širenje zvučnog vala kroz prostor. Audiometria; izofonske krivulje. Nivo intenziteta. dB. Nivo glasnoće. Odnos fizikalnih i fizioloških parametara. Ultrazvuk. Način rada i izvedba UZV uređaja. Fizikalne osnove. Dopplerov efekt. Način rada i izvedba UZV koji koristi dopplerov efekt. Fizikalna ograničenja UZV uređaja.

[HB]

 

 

Biofizika, radiologija i zaštita od zračenja, NG 2020./21.

1.      Katedra: Katedra za biofiziku, biologiju i kemiju

2.      Predmet: Osnove biofizike, radiologije i zaštite od zračenja

3.      Akademska  godina:  2020./2021.

4.      Godina studija: 1.

5.      Termin izvođenja nastave:

6.      Organizacija nastave: kontinuirana nastava

7.      Broj sati nastave prema vrsti nastave: Predavanja 20 sati, seminari 0 sati; vježbe 10 sati

8.      ECTS bodovi: 2

KONZULTACIJE:   Tijekom nastave sat vremena prije i poslije održavanja nastave u sobi nastavnika koji ima nastavu

 Obavezna literatura:

1. Nastavni tekstovi na stranici Katedre za Biofiziku: www.physics.mefos.hr, i u sustavu Merlin

2. JasminkaBrnjas - Kraljević: Fizikazastudentemedicine, Medicinskanaklada, Zagreb, 2001. ISBN: 9531761566.

3. JasminkaBrnjas - Kraljević: Autoriziranapredavanja (skripta).

4. radiologija

Dopunska literatura:

1. G.M. Cooper & R.E. Hausman: Stanica: molekularni pristup, Medicinska Naklada, Zagreb, 2004.str. 42 – 100

2. Eterović D: Fizikalne osnove slikovne dijagnostike, u: S. Janković i D. Eterović: Fizikalne osnove i klinički aspekti slikovne dijagnostike, Medicinska naklada, Zagreb, 2000.

3. www.iaea.org

 

OBLICI I TERMINI PROVJERE ZNANJA

Način polaganja ispita:

Način provjere znanja: (pismeni, usmeni, kolokvij, praktični dio  ispita)

(1)     pismeni ispit – 40 pitanja sa višestrukim odgovorima 

 

24, 25, 26  dovoljan (2)
27, 28, 29, 30, dobar (3)
31, 32, 33, 34 vrlo dobar (4)
35, 36, 37, 38, 39, 40 izvrstan (5);

(2)    seminarski zadatak - studenti će tijekom kolegija dobiti dva seminarska zadatka za izradu. Za svaki od točno izrađenih zadataka mogu dobiti jedan dodatni bod na ispitu. Zadatci se nalaze u sustavu merlin, a rješenja je potrebno poslati najkasnije do srijede 9. 12. 2020. u 20:00 na Ova e-mail adresa je zaštićena od spambota. Potrebno je omogućiti JavaScript da je vidite. . Zadatak poslati koristeći @fdmz.hr adresu, s predmetom poruke:

[SEMINAR] - Sestrinstvo NG - Ime i Prezime studenta

(2) usmeniispit (ukoliko student želi može umjesto pismenog ispita prijaviti usmeni ispit).

Ogledna pitanja iz ispita:

1. Zašto konj može povući kola (ako i kola vuku njega po 3. Newtonovom zakonu)?
     A.            zbog sile trenja između konja i podloge
     B.            zato sto konj vuče jače od kola
     C.            zato što je faktor elastičnosti užeta velik
     D.            zato što Newtonovi zakoni vrijede samo za vakuum
     E.            zbog težine potkova

2. Težina tijela:
     A.            je isto što i masa tijela
     B.            se mjeri vagom i ima jedinicu kg (kilogram)
     C.            se povećava s povećanjem volumena tijela
     D.            je sila kojom tijelo u gravitacijskom polju djeluje na podlogu
     E.            u vakumu je 0

3. Ukoliko se krvna žila suzi tri puta protok će:
     A.            se smanjiti 2 puta
     B.            se povećati 27 puta
     C.            se povećati 3 puta
     D.            se smanjiti 81 puta
     E.            se smanjiti 9 puta

 4. Ultrazvučni valovi ne prolaze kroz:
     A.            plin (zrak)
     B.            kost
     C.            a+b
     D.            parenhim bubrega
     E.            tekućinu

 5. Kao osnovni element kontrastnih sredstava za intravensku primjenu je
     A.            fluor
     B.            krom
     C.            brom
     D.            jod
     E.            kalij
 
 Redosljed izvođenja nastave (predavanja se odrzavaju preko sustava Microsoft Teams):
 

Vrijeme

Tema

Nastavnik

1. Dan – ponedjeljak

P1

16:00-19:00

Uvod u izvođenje kolegija, Način izvođenja kolegija, uvod u izvođenje vježbi. Poveznica na predavanje

[DF]

2. Dan – utorak

P2

16:00-19:00

Pojam sile i energije. Mehanika. Poveznica na predavanje

[DF]

3. Dan – srijeda

P3

16:00-19:00

Hidrostatika i hidrodinamika, upotreba u medicini. Tlak, protok, hemodinamika. Poveznica na predavanje

[HB]

4. Dan – četvrtak

P4

16:00-19:00

Ionizirajuće zračenje: Uporaba u medicini. Načela zaštite od zračenja. Dozimetrija i praktični primjeri. Medicinsko ozračenje. Zaštita od zračenja. Poveznica na predavanje

[DF]

5. Dan – petak

P5

13:00-19:00

Radiologija. Vrste radioloških pregleda. Uređaji u radiologiji, Poveznica na predavanje

[NG]
 
 

 

 

Hrvoje Brkić

Hrvoje Brkić

Department of Biophysics and Radiology

Faculty of Medicine

J. J. Strossmayer University in Osijek

J. Huttlera 4, 3100 Osijek

Ova e-mail adresa je zaštićena od spambota. Potrebno je omogućiti JavaScript da je vidite.

 

Degrees:

PhD in biophysics, Department of physics, University in Zagreb, 2014.

MSc in physics, Department of Physics, University J. J. Strossmayer in Osijek, 2007.

 

Profiles:

Google scholar

Web of Science: B-8477-2013

ORCID: 0000-0001-6692-6875

Scopus: 56181066000

Researchgate

Croatian scientific bibliography: 304856

 

 

Publications:

Journal articles

Scientific and review papers

Radovi u časopisima
Znanstveni i pregledni radovi

1. (EURADOS WG6) Rabus, Hans; Gomez-Ros, Jose-Maria; Villagrasa, Carmen; Eakins, Jonathan; Vrba, Tomas; Blideanu, Valentin; Zank, Maria; Tanner, Rick; Struelens, Lara; Brkić, Hrvoje et al.
Quality assurance for the use of computational methods in dosimetry: activities of EURADOS Working Group 6 "Computational Dosimetry // Journal of radiological protection, 41 (2021), 46-58 doi:10.1088/1361-6498/abd914 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

2. Švabić Kolacio, Manda; Brkić, Hrvoje; Faj, Dario; Smilović Radojčić, Đeni; Rajlić, David; Obajdin; Nevena; Jurković, Slaven
Validation of two calculation options built in Elekta Monaco Monte Carlo based algorithm using MCNP code // Radiation physics and chemistry, 179 (2021), 109237, 7 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

3. Galić, Stipe; Kovačević, Marin; Lasić, Ivan; Brkić, Hrvoje; Faj, Dario
A method of high resolution radiotherapy delivery fluences with a pair of fields with orthogonal collimator settings: a study on ten head and neck cancer patients // Journal of medical physics, 45 (2020), 1; 36-43 doi:10.4103/jmp.JMP_51_19 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

4. Ivković, Ana; Faj, Dario; Kasabašić, Mladen; Poje Sovilj, Marina; Krpan, Ivana; Grabar Branilović, Marina; Brkić, Hrvoje
The influence of shielding reinforcement in a vault with limited dimensions on the neutron dose equivalent in vicinity of medical electron linear accelerator // Radiology and oncology, 54 (2020), 2; 247-252 doi:10.2478/raon-2020-0024 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

5. Ivković, Ana; Faj, Dario; Galić, Stipe; Karimi, Amir Hossein; Kasabašić, Mladen; Brkić, Hrvoje
Accuracy of empirical formulas in evaluation of neutron dose equivalent inside the 60Co vaults reconstructed for medical linear accelerators // International Journal of Radiation Research, 18 (2020), 1; 99-107 doi:10.18869/acadpub.ijrr.18.1.99 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

6. Karimi, Amir Hossein; Brkić, Hrvoje; Shahbazi-Gahrouei, Daryoush; Haghighi, Biparva Somayeh; Jabbari, Iraj
Essential considerations for accurate evaluation of photoneutron contamination in Radiotherap // Applied radiation and isotopes, 145 (2019), Pages 1-258 (March 2019); 24-31 doi:10.1016/j.apradiso.2018.12.007 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

7. Agić, Dejan; Brkić, Hrvoje; Kazazić, Saša; Tomić, Antonija; Abramić, Marija
Aprotinin interacts with substrate-binding site of human dipeptidyl peptidase III // Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 37 (2019), 14; 3596-3606 doi:10.1080/07391102.2018.1521343 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

8. Tomić, Antonija; Horvat, Gordan; Ramek, Michael; Agić, Dejan; Brkić, Hrvoje; Tomić, Sanja
New zinc ion parameters suitable for classical MD simulations of zinc metallo-peptidases // Journal of chemical information and modeling, 59 (2019), 8; 3437-3453 doi:10.1021/acs.jcim.9b00235 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

9. Brkić, Hrvoje; Kasabašić, Mladen; Ivković, Ana; Agić, Dejan; Krpan, Ivana; Faj, Dario
Influence of head cover on the neutron dose equivalent in Monte Carlo simulations of high energy Medical linear accelerator // Nuclear Technology & Radiation Protection, 33 (2018), 2; 217-222 doi:10.2298/NTRP1802217B (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

10. Kralik, Ivana; Faj, Dario; Lauc, Tomislav; Škarica, Matko; Popić, Jelena; Brkić, Hrvoje
Dose area product in estimation of effective dose of the patients undergoing dental cone beam computed tomography examinations // Journal of radiological protection, 34 (2018), 4; 1412-1427 doi:10.1088/1361-6498/aae4e8 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

11. Agić, Dejan; Brkić, Hrvoje; Tomić, Sanja; Karačić, Zrinka; Špoljarević, Marija; Lisjak, Miroslav; Bešlo, Drago; Abramić, Marija
Validation of flavonoids as potential dipeptidyl peptidase III inhibitors: experimental and computational approach // Chemical biology & drug design, 89 (2017), 4; 619-627 doi:10.1111/cbdd.12887 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

12. Kralik, Ivana; Štefanić, Mario; Brkić, Hrvoje; Šarić, Gordan; Težak, Stanko; Grbac Ivanković, Svjetlana; Girotto, Neva; Štimac, Damir; Rubin, Otmar; Salha, Tamer et al.
Estimated collective effective dose to the population from nuclear medicine diagnostic procedures in Croatia: a comparison of 2010 and 2015 // PLoS One, 12 (2017), 6; e0180057, 13 doi:10.1371/journal.pone.0180057 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

13. Brkić, Nikolina; Terzić, Velimir; Švagelj, Marija; Cvrković, Mirta; Brkić, Hrvoje; Švagelj, Dražen
The prevalence and characteristics of Helicobacter pylori-associated gastritis in dyspeptic patients in Eastern Croatia, determined by immunohistochemistry // Periodicum biologorum, 119 (2017), 1; 75-80 doi:10.18054/pb.v119i1.4219 (međunarodna recenzija, kratko priopcenje, znanstveni)

14. Brkić, Hrvoje; Ivković, Ana; Kasabašić, Mladen; Poje Sovilj, Marina; Jurković, Slaven; Štimac, Damir; Rubin, Otmar; Faj, Dario
The influence of field size and off-axis distance on photoneutron spectra of the 18 MV Siemens Oncor linear accelerator beam // Radiation measurements, 93 (2016), 28-34 doi:10.1016/j.radmeas.2016.07.002 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

15. Brkić, Hrvoje
Insight of the iron binding and transport in Dke1 - A Molecular Dynamics Study // Croatica chemica acta, 88 (2015), 3; 297-306 doi:10.5562/cca2685 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

16. Istvanić, Tomislav; Vrselja, Zvonimir; Brkić, Hrvoje; Radić, Radivoje; Lekšan, Igor; Ćurić, Goran
Extended Eversion Carotid Endarterectomy: Computation of Hemodynamics // Annals of vascular surgery, 29 (2015), 8; 1598-1605 doi:10.1016/j.avsg.2015.05.034 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

17. Vrselja, Zvonimir; Brkić, Hrvoje; Ćurić, Goran
Arterial tree asymmetry reduces cerebral pulsatility // Medical hypotheses, 85 (2015), 622-627 doi:10.1016/j.mehy.2015.07.030 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

18. Brkić, Hrvoje; Kovačević, Borislav; Tomić, Sanja
Human 3-hydroxyanthranilate 3, 4-dioxygenase (3HAO) dynamics and reaction, a multilevel computational study // Molecular biosystems, 11 (2015), 3; 898-907 doi:10.1039/C4MB00668B (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

19. Poje, Marina; Ivković, Ana; Jurković, Slaven; Žauhar, Gordana; Vuković, Branko; Radolić, Vanja; Miklavčić, Igor; Kaliman, Zoran; Planinić, Josip; Brkić, Hrvoje; Faj, Dario
The Neutron Dose Equivalent Around High Energy Medical Electron Linear Accelerators // Nuclear Technology & Radiation Protection, 29 (2014), 3; 207-212 doi:10.2298/NTRP1403207P (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

20. Vrselja, Zvonimir; Brkić, Hrvoje; Mrđenović, Stefan; Radić, Radivoje; Ćurić, Goran
Function of circle of Willis // Journal of cerebral blood flow and metabolism, 34 (2014), 4; 578-584 doi:10.1038/jcbfm.2014.7 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

21. Hrvoje, Brkić; Daniela, Buongiorno; Michael, Ramek; Grit, Straganz; Sanja, Tomić
Dke1 – Structure, Dynamics and Function, A Theoretical and Experimental Study Elucidated the Role of the Binding Site Shape and the H-Bonding Network in Catalysis // Journal of biological inorganic chemistry, 17 (2012), 5; 801-815 doi:10.1007/s00775-012-0898-8 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

22. Ciraj Bjelac, Olivera; Faj, Dario; Štimac, Damir; Košutić, Duško; Aranđić, Danijela; Brkić, Hrvoje
Good reasons to implement quality assurance in nationwide breast cancer screening programs in Croatia and Serbia: results from a pilot study // European journal of radiology, 78 (2011), 1; 122-128 doi:10.1016/j.ejrad.2009.10.004 (međunarodna recenzija, članak, znanstveni)

23. Galic, Stipe; Kovacevic, Marin; Lasic, Ivan; Brkic, Hrvoje; Faj, Dario
A method of high-resolution radiotherapy delivery fluences with a pair of fields with orthogonal collimator settings: A study on ten head-and-neck cancer patients // Journal of Medical Physics, 45 (2020), 1; 36-43 doi:10.4103/jmp.jmp_51_19 (međunarodna recenzija, članak, stručni)

24.Vrselja, Zvonimir; Brkić, Hrvoje; Ćurić, Goran
Penetrating arteries of the cerebral white matter : The importance of vascular territories of delivering arteries and completeness of circle of Willis // International journal of stroke, 11 (2016), 3; NP36-NP37 doi:10.1177/1747493015616639 (podatak o recenziji nije dostupan, pismo uredniku, znanstveni)

25. Matić, Sara; Kekez, Ivana; Tomin, Marko; Bogár, Ferenc; Šupljika, Filip; Kazazić, Saša; Hanić, Maja; Jha, Shalinee; Brkić, Hrvoje; Bourgeois, Benjamin et al.
Binding of dipeptidyl peptidase III to the oxidative stress cell sensor Kelch-like ECH-associated protein 1 is a two-step process // Journal of biomolecular structure & dynamics (2020) doi:10.1080/07391102.2020.1804455 (međunarodna recenzija, prihvaćen)

 

Dissertations and thesis

Doctoral dissertation

Brkić, Hrvoje
Computational studies of iron dependent dioxygenases. 2014., doctoral thesis, Faculty of natural sciences, Physics department, Zagreb


 

Program radionice

                                           Programme of the National workshop on CT - CRO6015

 Rijeka, Croatia, 11-15 April 2016

 

 

Day1 - MO

11 April

Title

Description

Lecturer

9:00-9:30

Administrative matters and workshop introduction. Participants self-introduction

 

 

9:30-10:30

The state of the art of CT scanner (An overview of state of the art CT scanners: X-ray tubes, Gantry, Detectors)

Lecture

KM

10:30-11:00

Tea/Coffee break

11:00-11:30

Tube current modulation (How it is implemented in different makes and model of state of the art scanners)

Lecture

MB

11:30-12:00

Iterative Reconstructions (Iterative reconstructions in the image space or in the sinogram space. Modeling the physics in the iterative reconstruction for transmission computed tomography.

Lecture

MB

12:00-12:30

Iterative Reconstructions (To understand differences in the different makes and model of state of the art scanners)

Lecture

KM

12:30-14:00

Lunch break

14:00-15:30

Workshop on the use of TCM in protocol optimization (How to configure the relevant parameters during acquisition)

Hospital

KM-MB-DP-SJ

15:30-16:00

Refreshment Break

16:00-17:30

Workshop on the use of iterative reconstruction in protocol optimization

Hospital

KM-MB-DP-SJ

 

Day2 - TU

12 April

Title

Description

Lecturer

9:00-9:45

CT dosimetry Standard and advanced metrics to quantify CT dose (CTDI, DLP, SSDE). Patient-specific and scanner-specific Monte Carlo simulation.

Lecture

MB

9:45-10:30

Image quality definition (Standard and advanced metrics to quantify Image quality: sharpness, contrast, Noise, SNR, CNR, NEQ, DQE and how these metrics behave as a function of the dose)

Lecture

MB

10:30-11:00

Tea/Coffee break

11:00-11:30

Creating good scanning protocols

Lecture

KM

11:30-12:15

Radiation dose considerations for chest CT (including low kV)

Lecture

KM

12:30-14:00

Lunch break

14:00-15:30

QC- Data acquisition. CT dosimetry (data acquisition)

(Medical Physicists and Radiographers)

Hospital

MB-DP

14:00-14:30

Justification and Protocols settings in CT. Example of existing and working justification system. (Radiologists)

Lecture

KM

14:30-15:15

Radiation dose considerations for abdominal CT (including low kV)

 

 

15:30-16:00

Refreshment Break

16:00-17:30

All: CT image quality in different conditions (data acquisition)

Hospital

MB-DP-KM

 

Evaluation of image quality: excercise

 

 

 

 

 

Day3 - WE

13 April

Title

Description

Lecturer

9:00-9:45

Radiation Dose of CT Examinations (Review of radiation dose associated with the most common types of diagnostic CT)

Lecture

DP

9:45-10:30

Diagnostic Reference Levels in CT (Review of the internationally established DRLs adults and paediatric)

Lecture

MB

10:30-11:00

Tea/Coffee break

11:00-11:30

CT dose management in pediatric patients

Lecture

KM

11:30-12:00

CT Dose management of pregnant patients

Lecture

KM

12:00-12:30

CT dose management for head CT

 

 

12:30-14:00

Lunch break

14:00-15:00

Setting CT protocols according to specific clinical question (Analysis of data of CT protocols collected in 4 hospitals)

Lecture

KM-DP-MB

15:00-15:30

Refreshment Break

15:30-17:00

Protocol implementation process,( few basic protocols vs as specific as possible protocols, i.e. many protocols, the way of assigning protocols, communication between technicians and attendings, management of findings not related to clinical question which are not able to be characterized on the performed study)

Round Table

KM-DP-MB

 

 

Day4 - THU

14 April

Title

Description

Lecturer

9:00-9:45

The effect of scout view orientation on dose and image quality

Lecture

DP

9:45-10:30

Acceptance testing and QC of CT scanners (Acceptance/commissioning testing: purpose, types, examples. Suspensions levels in CT)

Lecture

MB

10:30-11:00

Tea/Coffee break

11:00-11:45

Radiation Dose Index monitoring (RDIM) systems and establishment of local DRLs (PACS, Networking,DICOM Dose Structured Report, Overview of RDIM systems, Use of RDIM systems to establish local DRLs, optimization and organ dose evaluation)

Lecture

DP

11:45-12:30

CT Dose evaluation (How to use Software for CT patient dose evaluation)

Lecture

MB

12:30-13:30

Lunch break

13:30-15:00

QC- Data Analysis and Interpretation

Lecture

MB-KM-DP

 

CT dosimetry (data analysis)

 

 

 

Analyzing data of CT dose collected in 4 hospitals

 

 

 

Calculation of patient dose: exercise

 

 

15:00-15:30

Refreshment Break

15:30-17:00

CT image quality (data analysis)

Lecture

KM-MB-DP

 

Analyzing data of CT image quality collected in 4 hospitals

 

 

 

Discussion

 

 

 

 

Day5 - FRI

15 April

Title

Description

Lecturer

9:00-9:45

Relation of technical and clinical image quality in CT?

 

Lecture

KM-MB

9:45-10:30

Dual Energy CT: Technology and Dose

Lecture

KM

10:30-11:00

Refreshment Break

11:00-11:45

Dual energy CT: Clinical applications

Lecture

KM

11:45-12:30

Risk assessment and communication in CT

Lecture/Discussion

MB and KM (for discussion)

12:30-13:00

Questionnaire/Certificate/Closure

 

 

12:30-13:30

Lunch

Više članaka ...